Il treno 5396 parte alle ore 05:06, generalmente dal binario 1
Il treno 5396 arriva alle ore 07:47, generalmente al binario 5
La durata prevista del viaggio è di 2 ore e 41 minuti
Il treno 5396 presenta una carrozza attrezzata per il trasporto di passeggeri su sedia a rotelle
Il treno 5396 effettua servizio di trasporto bici al seguito.
| Stazione | Arrivo | Partenza | Bin. |
| SIRACUSA Orari treni stazione Siracusa | 05:06 | 1 | |
| AUGUSTA Treni da Siracusa a Augusta | 05:26 | 05:26 | 2 |
| LENTINI Treni da Siracusa a Lentini | 05:47 | 05:47 | 1 |
| CATANIA AEROPORTO FONTANAROSSA Treni da Siracusa a Catania Aeroporto Fontanarossa | 06:04 | 06:04 | 2 |
| CATANIA CENTRALE Treni da Siracusa a Catania Centrale | 06:17 | 06:17 | 5 |
| ACIREALE Treni da Siracusa a Acireale | 06:30 | 06:30 | 2 |
| GIARRE RIPOSTO Treni da Siracusa a Giarre Riposto | 06:40 | 06:40 | 2 |
| FIUMEFREDDO DI SICILIA Treni da Siracusa a Fiumefreddo Di Sicilia | 06:51 | 06:51 | 1 |
| ALCANTARA Treni da Siracusa a Alcantara | 06:57 | 06:57 | 3 |
| TAORMINA-GIARDINI Treni da Siracusa a Taormina-giardini | 07:01 | 07:01 | 1 |
| S.TERESA DI RIVA Treni da Siracusa a S.teresa Di Riva | 07:15 | 07:15 | 1 |
| ROCCALUMERA MANDANICI Treni da Siracusa a Roccalumera Mandanici | 07:22 | 07:22 | 2 |
| MESSINA CENTRALE Orari treni stazione Messina Centrale | 07:47 | 5 |